Il castello di Zante come quello di S. Giorgio a Cefalonia  è oggetto di aggiustamenti, non di rifacimenti radicali, né di un deciso cambio di funzione, così come era stato operato per la fortezza di Asso . Le preoccupazioni maggiori sembrano indirizzarsi verso l'evidente declino del monopolio del commercio veneziano in Levante. La Venice Company, poi Levant Company, viene creata dagli inglesi nel 1583 per organizzare l'importazione nella madrepatria di uve passe, vini, olio, ma già nel 1580 il Provveditore  dell'isola lamenta la presenza da ormai quattro anni di 4 o 5 navi inglesi "di bona portata", con "grandissimo danno" per la città e per le sue entrate. Un altro Provveditore dirà nel 1622 che la crisi del porto si doveva attribuire sì ad una recente pestilenza, ma forse ancor di più al fatto che "manchò agli abitanti il mercantar".

La politica urbanistica veneziana è quindi maggiormente indirizzata all'approntamento di strutture portuali e civili piuttosto che militari: in questo senso va letta l'istituzione del lazzaretto , contemporaneamente a quanto si fa per Corfù , nel 1589, dell'allungamento del molo nel 1608, dell'ingrandimento dell'Arsenale .